生物质燃料的应用领域较为广泛，主要包括以下几个方面：
发电领域
直接燃烧发电：将生物质燃料直接送入锅炉中燃烧，产生高温高压的蒸汽，推动汽轮机转动，进而带动发电机发电。这种方式适用于大规模的生物质资源集中利用，如大型生物质发电厂，可利用农作物秸秆、林业废弃物等作为燃料。
混燃发电：将生物质燃料与煤炭等传统化石燃料按一定比例混合后在锅炉中燃烧发电。这种方式可以在不改变现有发电设备主要结构的前提下，部分替代化石燃料，减少煤炭消耗和污染物排放，同时提高发电效率。
气化发电：先将生物质燃料在气化炉中进行气化，转化为可燃气体，如一氧化碳、氢气、甲烷等，然后将这些气体送入燃气轮机或内燃机中燃烧发电。气化发电系统相对灵活，适用于中小规模的生物质资源利用，且发电效率较高。
供热领域
民用供热：生物质颗粒燃料或生物质成型燃料可以用于家庭、学校、医院等场所的供暖和热水供应。通过专门设计的生物质取暖炉或热水锅炉，将生物质燃料燃烧产生的热量传递给室内的供暖系统或热水系统，为人们提供温暖舒适的生活和工作环境。

工业供热：在一些工业生产过程中，需要大量的热能，如纺织、印染、造纸、食品加工等行业。生物质燃料可以替代煤炭、天然气等传统能源，为工业生产提供蒸汽或热水，满足生产过程中的供热需求，降低企业的能源成本和环境污染。

交通运输领域
生物乙醇：以玉米、小麦、甘蔗等为原料，通过发酵、蒸馏等工艺生产生物乙醇。生物乙醇可以与汽油按一定比例混合制成乙醇汽油，用于汽车发动机。乙醇汽油具有较高的辛烷值和清洁燃烧性能，能够减少汽车尾气中的污染物排放，提高燃油的燃烧效率。
生物柴油：利用动植物油脂、废食用油等为原料，通过酯交换反应生产生物柴油。生物柴油可直接用于柴油发动机，也可与石化柴油按一定比例混合使用。生物柴油具有良好的润滑性能、燃烧性能和环境友好性，能够降低柴油发动机的尾气排放，尤其是颗粒物和硫化物的排放。
其他领域
农村能源供应：在农村地区，生物质燃料可以作为一种重要的能源来源，满足农民的生活用能需求，如做饭、取暖等。通过发展农村户用沼气池、生物质炉灶等技术，将农作物秸秆、畜禽粪便等转化为清洁的燃气或热能，实现农村能源的自给自足，改善农村生活环境。
区域能源系统：在一些特定的区域，如工业园区、生态园区等，可以建立以生物质燃料为核心的区域能源系统。将区域内的生物质资源进行统一收集、处理和利用，通过生物质发电、供热、供气等多种方式，为区域内的企业、居民提供综合能源服务，实现能源的高效利用和循环经济发展。